Der Direktor der Salzburger Landes-Brandschaden-Versicherungs-Anstalt wirkt ab Jänner 1924 als Vertreter der Landesregierung im Hauptausschuss des Landesverbandes für Feuerwehr- und Rettungswesen und gehört 1930 zu den Initiatoren zur Errichtung der „Brandverhütungsstelle“.

Am 22. Februar 1931 wird Zauner von den Verbandsfunktionären zum Präsidenten des Gesamtverbandes gewählt und im Sinne des Feuerwehrgesetzes vom 13. September 1935 von Landeshauptmann Rehrl zum Landesfeuerwehrführer bestellt. Seine Arbeit für das Feuerwehr- und Rettungswesen ist gekennzeichnet von einer engen Zusammenarbeit mit Landesfeuerwehrinspektor Prack.

In der Nacht des „Umbruchs“ (11. auf 12. März 1938) wird Franz Zauner aus politischen Gründen als Landesfeuerwehrführer abgesetzt, seinen Direktionsposten verliert er ebenso. Bald danach erkrankt er schwer und verstirbt am 11. Oktober 1939. Der neue Landesfeuerwehrführer findet dazu weder ein Wort des Dankes noch des Mitgefühls.
Franz Zauner ist Träger hoher Auszeichnungen, darunter auch das „Österreichische Feuerwehr-Ehrenzeichen“.